日韩av在线播放不卡丨午夜av资源丨午夜视频免费看丨亚洲美女性生活丨人人爱人人草丨91国产精品一区丨中文在线字幕av丨国产精品aⅴ丨人人爽人人澡人人人人妻丨久久三级中文欧大战字幕丨高hnp视频丨久久日av丨美国伊人网丨大乳三级a做爰大乳丨日本亚洲中文字幕不卡丨美女张开腿黄网站免费下载丨韩国伦理av丨欧洲美女粗暴牲交免费观看丨亚洲资源av无码日韩av无码丨欧美极品在线视频丨夜夜爽8888天天躁夜夜躁狠狠丨国产精品一卡二卡三卡破解版丨忘忧草在线社区www中国中文丨国产成人精品777丨精人妻无码一区二区三区

生物膜（biofilm）也稱為生物被膜，是指附著于有生命或無(wú)生命物體表面被細(xì)菌胞外大分子包裹的有組織的細(xì)菌群體。由于生物膜在環(huán)境中隨處可見，對(duì)抗生素抗性很強(qiáng)，因此，生物膜形成機(jī)理及調(diào)控吸引了很多研究人員的注意。我們使用土壤細(xì)菌，熒光假單胞菌作為模式生物，研究如何控制這種細(xì)菌生物膜的形成。

Shiro Yoshioka 說(shuō)：“Phenom ProX 和 ParticleMetric 軟件結(jié)合使用，有效地統(tǒng)計(jì)出生物膜中的桿形細(xì)菌的尺寸信息”

轉(zhuǎn)座子突變通常用于標(biāo)識(shí)所需的生物膜形成的基因。將轉(zhuǎn)座子插入到參與生物膜的形成的基因中，該突變體可以顯示基于這種基因，生物膜形成增加或減少情況。通過這種技術(shù)，我們找到了負(fù)責(zé)合成細(xì)菌第二信使的一種基因。

相對(duì)于與野生型菌株，c-di-GMP 的損失引起了生物膜形成的減少。在本次研究中，我們也發(fā)現(xiàn)，破壞 de novo 嘌呤核苷酸生物合成的一個(gè)基因也可以引起生物膜形成的減少。因?yàn)檫@種基因?qū)τ谏锖铣赏緩缴系闹匾栽诙喾N細(xì)菌上被報(bào)導(dǎo)，我們研究了這些突變體，弄清了這種生物合成途徑與熒光假單胞菌生物膜形成之間的關(guān)系。

Phenom ProX 對(duì)于生物膜研究的應(yīng)用

雖然突變體形成的生物膜減至不到 WT 的一半，細(xì)胞計(jì)數(shù)實(shí)驗(yàn)表明，生物膜中的突變細(xì)胞數(shù)目與 WT 相當(dāng)。要解釋這一結(jié)果，我們推測(cè)突變體在生物膜中的細(xì)胞尺寸變得比 WT 更小。換句話說(shuō)，突變引起生物膜細(xì)胞細(xì)胞尺寸減少。這種假設(shè)也有依據(jù)，因?yàn)橥蛔凅w不能合成 AMP 和 GMP，可能導(dǎo)致突變體的增長(zhǎng)放緩。

掃描電子顯微鏡 (SEM) 是檢查細(xì)菌生物膜中細(xì)胞大小的*方法之一。為了獲取有關(guān)生物膜中細(xì)菌細(xì)胞的尺寸信息，我們使用一個(gè)桌面掃描電鏡，Phenom ProX，使得我們可以樣品制備后的一分鐘內(nèi)獲得掃描電鏡圖像。這快的速度使得我們可以針對(duì)每個(gè)突變采集多張顯微照片以便通過 ParticleMetric 軟件進(jìn)一步詳細(xì)分析。圖 1 為 Phenom ProX 拍攝的熒光假單胞菌清晰的圖片。

圖 1

生長(zhǎng)在聚氯乙烯表面熒光假單胞菌生物膜細(xì)胞的掃描電鏡圖像 (放大倍率︰ 12，000 x)

飛納電鏡 Phenom ParticleMetric 軟件的強(qiáng)大力量

掃描電鏡圖像比較明確顯示出突變體的尺寸發(fā)生了減小。然而，它很難定量描述 WT 和突變體細(xì)胞大小的區(qū)別。Phenom ProX 的 ParticleMetric  軟件能夠快速識(shí)別掃描電鏡圖像中的每個(gè)細(xì)胞的各種參數(shù)。因?yàn)闊晒饧賳伟菞U形的，外接的圓直徑可以很好的近似為細(xì)胞的長(zhǎng)度。使用此軟件，我們從幾個(gè)掃描電鏡圖像中收集超過 1,500 的單個(gè)細(xì)胞的外接的圓直徑，創(chuàng)建直方圖，并計(jì)算相關(guān)的外接的圓直徑 (圖 2) 中位數(shù)。

Phenom ParticleMetric  軟件自動(dòng)執(zhí)行此過程。我們*的關(guān)注點(diǎn)的是自動(dòng)顆粒檢測(cè)有時(shí)將聚集細(xì)胞視為單個(gè)細(xì)胞。ParticleMetric 允許直觀地從數(shù)據(jù)中移除這種細(xì)胞。計(jì)算的結(jié)果顯示，該突變細(xì)胞的長(zhǎng)度相對(duì)于 WT 比縮減了 25 ~ 30%。因此，Phenom ProX 和 ParticleMetric 軟件的證據(jù)，成功地證明了我們做出的“突變的細(xì)胞在生物膜中相對(duì)于 WT 變得更小”的假設(shè)。

圖 2
ParticleMetric 軟件生成的統(tǒng)計(jì)了超過 1,500 個(gè)熒光假單胞菌生物膜細(xì)胞的外接圓直徑的直方圖，外接的圓直徑的中位數(shù)計(jì)算結(jié)果是 1.79µm，除了直方圖，也可以顯示任何一個(gè)選定細(xì)胞的參數(shù)

結(jié)論

Phenom ProX 桌面掃描電鏡和 ParticleMetric 軟件有效地統(tǒng)計(jì)了生物膜內(nèi)細(xì)菌細(xì)胞的大小數(shù)據(jù)，對(duì)生物膜研究中的應(yīng)用提供有價(jià)值的信息。因?yàn)樵S多細(xì)菌由于養(yǎng)分有效性或抗生素而改變它們的大小和形態(tài)，在細(xì)胞的大小和形態(tài)的識(shí)別與統(tǒng)計(jì)將是未來(lái)的研究在生物膜研究的必要條件。Phenom ProX 和簡(jiǎn)單易用快速的 ParticleMetric 軟件將為微生物的研究人員提供很大的幫助。